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核酸檢測那些事兒

2022-05-13 17:26 來(lái)源:DeepTech深科技 次閱讀
 
核酸檢測那些事兒
  一場(chǎng)突如其來(lái)的疫情,讓核酸、抗原、PCR、cT 值等等這些本來(lái)專(zhuān)業(yè)度極高的名詞逐步進(jìn)入了大眾視野。今天,小編就為大家科普一下:新冠檢測的那些事。

  PCR 核酸檢測到底是什么東東?

  PCR (Polymerase Chain Reaction,聚合酶鏈式反應) 技術(shù)是一項偉大的發(fā)明,沒(méi)有 PCR 技術(shù)的發(fā)明,就沒(méi)有現代分子生物學(xué)。PCR 技術(shù)將生物學(xué)劃分為了兩個(gè)時(shí)代:PCR 前時(shí)代和 PCR 后時(shí)代。PCR 技術(shù)之父穆利斯(Kary Mullis)也因此獲得了 1993 年諾貝爾化學(xué)獎。PCR 技術(shù)也徹底改變了遺傳學(xué)、醫學(xué)、法醫學(xué)等多個(gè)學(xué)科,讓人類(lèi)才得以開(kāi)展基因檢測、病毒感染鑒定、遺傳篩查等等重大舉措。

  簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),PCR 核酸檢測就是把核酸按指數級放大直至能被機器檢測識別到。核酸很小,一個(gè)核酸肉眼無(wú)法看到,但如果把核酸放大,1 個(gè)變 2 個(gè),2 個(gè)變 4 個(gè),4 個(gè)變 8 個(gè),當變到足夠多數量時(shí),很大一群核酸就能被檢測到。因此PCR技術(shù)就是把核酸擴增的手段。

  什么是核酸陽(yáng)性和陰性?

  在核酸檢測中,通常用陰性和陽(yáng)性來(lái)表示結果。陽(yáng)性代表著(zhù)檢測到病毒,陰性則代表正常。當然所有的事情都不可能如此簡(jiǎn)單的一分為二,此時(shí)就出現一個(gè)問(wèn)題:病毒的載量有多有少,如何來(lái)衡量檢測到病毒,多少病毒的時(shí)候又會(huì )引起人們發(fā)病。

  答案是通過(guò) CT 值。

  C 是 cycle, T 是 threshold,CT 值代表 PCR 的循環(huán)數。前面已經(jīng)提到 PCR 技術(shù)是將病毒的核酸進(jìn)行指數擴增,一個(gè)拷貝變兩個(gè)、兩個(gè)變四個(gè)、四個(gè)變八個(gè)等等,直到能被儀器檢測到。如果 ct 值為 40,那就表示當所檢測的該病毒的核酸被放大了 2 的 40 次方后,它能被被儀器檢測到。

  所以 ct 值越小,說(shuō)明不用放大多少倍就能檢測到病毒,這代表病毒濃度越高,越容易被檢測到。反之,如果 ct 值越高,代表病毒含量較少?!缎滦凸跔畈《痉窝自\療方案(試行第九版)》提到,處于恢復期的感染者在核酸 ct 值 ≥ 35時(shí),樣本中未能分離出病毒,密切接觸者未發(fā)現被感染的情況。

  不同的核酸檢測機構做出來(lái)的結果會(huì )一致么?

  PCR 核酸檢測有嚴格的標準化流程,這個(gè)標準化流程是經(jīng)過(guò)全世界各地科學(xué)家大量的研究?jì)?yōu)化制定的,是同一份 SOP(Standard Operation Protocol)。同時(shí)所有的核酸實(shí)驗室,不論大小,都要沿用同樣的技術(shù)要求,實(shí)驗室的布局建設軟裝硬裝也有統一規范。就連實(shí)驗室檢測工作人員也要經(jīng)過(guò)標準規范的技術(shù)培訓,獲得國家認可的上崗證書(shū)才得以開(kāi)展工作。這就好比 KFC 的炸雞都是用的同一個(gè)配方,不論是車(chē)站的快捷小窗口還是市中心寬敞舒適的堂食,或是宅急送,你總是能吃到同一個(gè)味道的炸雞,不用擔心會(huì )踩雷。

  因此,不論核酸檢測是在哪個(gè)機構完成,其結果都應該是一致的。

  為什么初篩陽(yáng)性要重新采樣進(jìn)行復核?

  新冠核酸檢測必須經(jīng)過(guò)兩個(gè)流程:首先是檢測機構的第一次檢測(初篩),如果是陽(yáng)性結果,那么該人員就被成為初篩陽(yáng)性人員。第二步所有初篩陽(yáng)性樣本都需要由更高資質(zhì)的機構進(jìn)行復采復核,確保每一個(gè)結果都準確無(wú)誤。

  經(jīng)過(guò)重新采樣、重復檢測后,有可能判定為新冠核酸陽(yáng)性,也有可能復測結果是陰性,“可疑樣本”被排除。一般可疑樣本有兩種可能性:一是 CT 位于灰區,二是病毒的某個(gè)單靶標基因因為某種意外情況顯現陽(yáng)性。

  而在發(fā)生初篩陽(yáng)性人員時(shí)就啟動(dòng)應急處置,是為了充分利用接報后黃金4小時(shí)的應急處置時(shí)間,全鏈條精準防控,快速處置,盡可能把疫情控制在萌芽狀態(tài)。

  為什么有的人鼻拭子陽(yáng)?咽拭子陰?甚至還要測肛拭子?

  由于新冠病毒是經(jīng)呼吸道傳播,因此采集不同部位的標本有不同的臨床意義,除了人們熟知的鼻拭子和咽拭子,其實(shí)還有痰液、血液和肛拭子等也可進(jìn)行采集:

  鼻拭子和咽拭子——上呼吸道標本

  痰液——下呼吸道標本

  肛拭子——消化道標本

  血液——抗體檢測標本

  上呼吸道標本(鼻咽拭子、口咽拭子)病毒載量在臨床癥狀初期 1-3 天較高,一周后開(kāi)始緩慢下降,下呼吸道標本(痰液)中的病毒載量通常在發(fā)病后 2 周內達到高峰,且病毒載量高于上呼吸道樣本,糞便樣本中病毒載量通常在發(fā)病后 2-3 周達到頂峰,總體載量低于痰液樣本,血清中抗體在一周以后可檢測到,同時(shí)還可以判斷過(guò)往是否發(fā)生過(guò)感染。

  因此最近出現的病例中提到患者有感染癥狀,但呼吸道標本新冠核酸陰性時(shí),可進(jìn)行多點(diǎn)多部位多次采集。

  比如,新英格蘭醫學(xué)雜志(New England Journal of Medicine)最近發(fā)表了一篇文章,描述了鼻拭子和咽拭子的病毒載量與疾病進(jìn)展后的關(guān)系,揭示了患者出現癥狀后新冠病毒的病毒載量動(dòng)態(tài)變化,新冠肺炎早期,病毒載量高,隨后逐漸降低。



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  如上所示,鼻拭子樣本中的病毒載量要高于咽拭子樣本,且高病毒載量出現在疾病早期,即出現癥狀后 2 天左右,而后逐漸降低。因此有可能出現鼻拭子檢測為陽(yáng)性,而咽拭子檢測出陰性結果。

  為什么會(huì )出現抗原陰核酸陽(yáng)的情況?

  2022 年 2 月 Lancet 上的一篇綜述,表示了抗原檢測和 RNA 檢測是發(fā)生在感染的 0~7 天內,抗原檢測的靈敏度遠低于 RNA 檢測,抗原檢測只能檢測到 105~106 拷貝數,而 RNA 檢測可達到的 102~103 拷貝數??贵w檢測通常發(fā)生在感染后的 7~14 天,檢測包括 IgG 和 IgM。

  由此可見(jiàn),當病毒載量少的時(shí)候,抗原無(wú)法檢測到,而換成高靈敏度的 RNA 檢測即可檢出,這就是為什么抗原陰核酸陽(yáng)的原因,同時(shí)也解釋了疾控中心為什么建議抗原和 RNA 檢測相互補充。

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  多長(cháng)時(shí)間會(huì )出現陽(yáng)轉陰?


  最快 3 天,一般在 7 天,最晚不超過(guò)14 天

  根據美國約翰霍普金斯大學(xué)的研究人員最近發(fā)表在《內科年鑒》上的一項研究發(fā)現,通常在出現癥狀的前幾天,得到假陰性結果的概率可以從第一天的 100% 到第四天的 67% 不等。癥狀開(kāi)始顯現后,假陰性結果發(fā)生率在第 5 天下降到 38%,第 8 天下降到 20%,但此后每天又開(kāi)始上升。換言之,陽(yáng)性患者可能最快在第四天即開(kāi)始出現陰性,根據個(gè)人體質(zhì)、免疫系統及疫苗等綜合情況,各自轉陰時(shí)間不一定,但基本在一周內會(huì )轉陰。

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  圖 | 感染新冠后可能核酸檢測結果為陰性的概率(上)和核酸檢測結果為陰性后感染新冠的概率(下),按暴露后的天數計算;CT 值隨時(shí)間變化曲線(xiàn)圖(來(lái)源:New England Journal of Medicine)


  轉陰的影響因素復雜,綜合自身免疫系統、是否有基礎疾病、疫苗情況等等,其中免疫系統就像是人體的護衛軍,當免疫力強的時(shí)候,病毒就弱,可能很快就會(huì )痊愈,也許睡了一覺(jué)起來(lái)就陽(yáng)轉陰;而當免疫力弱的時(shí)候,病毒就強,需要一段時(shí)間的恢復。

  也正是因為這種病毒和免疫系統的復雜拉鋸戰,所以才需要定期密集采樣檢測,起到實(shí)時(shí)監測病情的進(jìn)展的效果。

  哪些因素可能會(huì )影響核酸檢測結果?

  病毒載量:綜上所述,病毒載量較低時(shí),可能會(huì )發(fā)生無(wú)法檢測到病毒的情況。

  冠狀病毒有可能發(fā)生變異,也可能會(huì )在未來(lái)進(jìn)一步影響檢測的準確性。因為這些測試是在流行病早期開(kāi)發(fā)的,而病毒會(huì )隨著(zhù)時(shí)間的推移而變異,可能會(huì )導致測試結果不匹配。

  采樣方法:在最近報道的真實(shí)采樣場(chǎng)景中,很多被采者反饋拭子只是在口腔中左右旋轉,感覺(jué)只沾到了口水,并沒(méi)有抵達舌腭弓,被采者也未出現惡心和反射性保護動(dòng)作,這種采樣大概率沒(méi)有采到呼吸道脫落細胞,因此容易出現漏檢,造成假陰性結果。


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  標本質(zhì)量:標本采集后的保存、運輸和信息登記等環(huán)節至關(guān)重要。某一環(huán)節處理不當均會(huì )造成假陽(yáng)性或假陰性結果。因此標本采集后應密封貼碼后,用生物安全轉運箱送至核酸檢測實(shí)驗室,注意避免標本的傾倒漏灑。信息登記應改進(jìn)流程,減少人工登記誤差,多采用計算機讀取信息技術(shù)。


  試劑靈敏度:試劑的靈敏度和病毒載量及病毒檢出率密切相關(guān)。當病毒載量低的時(shí)候,若試劑盒靈敏度不夠,容易出現假陰性,造成漏檢,而當換一個(gè)高靈敏度的試劑盒時(shí),則出現了所謂的“陰轉陽(yáng)”,但其實(shí)只是更高的靈敏度試劑盒檢出了低病毒載量。因此結合上述提到的病毒載量隨時(shí)間進(jìn)程變化,應注意采樣的時(shí)間,以及選擇合適的試劑盒,同時(shí)要定期監測病毒載量變化。

  實(shí)驗室污染:上述已介紹過(guò)在實(shí)驗過(guò)程中,會(huì )搭配兩種陽(yáng)性質(zhì)控來(lái)保證實(shí)驗結果的可靠性。但如果陽(yáng)性質(zhì)控暴露造成實(shí)驗室污染,則會(huì )出現假陽(yáng)性。所以實(shí)驗過(guò)程中一定要進(jìn)行嚴格的質(zhì)控實(shí)驗,隨時(shí)監測陰性質(zhì)控和陽(yáng)性質(zhì)控的變化,以此來(lái)及時(shí)發(fā)現實(shí)驗室污染而采取必要的消殺措施。

  人類(lèi)和病毒的戰爭從未停止,面對像新冠這類(lèi)新出現的而且容易變異的病毒,即使有再先進(jìn)的醫學(xué)技術(shù),也往往需要時(shí)間和經(jīng)驗的不斷積累才能漸漸得窺全貌。相信和尊重科學(xué),保持求知探索,同時(shí)給予醫護工作者和科學(xué)家們充分的支持和耐心,是我們每個(gè)人的責任。

  -End-

  參考:

  1、Presence of mismatches between diagnostic PCR assays and coronavirus SARS-CoV-2 genome.https://doi.org/10.1098/rsos.200636

  2、Lauren M. Kucirka etc, Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction–Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure, Annals of InternalMedicine, Aug, 2020

  3、SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients, Lirong Zou, Feng Ruan, N Engl J Med. 2020 Mar 19; 382(12): 1177–1179. doi: 10.1056/NEJMc2001737

  4、Rosanna W Peeling, David L Heymann, Yik-Ying Teo, Patricia J Garcia, Diagnostics for COVID-19: moving from pandemic response to control,Lancet 2022; 399: 757–68
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