疾病發(fā)生發(fā)展的背后,影響因素往往錯綜復雜。如果從網(wǎng)絡(luò )角度,將每個(gè)因素看成一個(gè)個(gè)“節點(diǎn)”,將它們之間的聯(lián)系看作一條條“邊”,那么人類(lèi)或許能夠從新的角度探究疾病形成的內在機理。
不久前,北京雁棲湖應用數學(xué)研究院教授鄔榮領(lǐng)及其帶領(lǐng)的統計團隊和北京林業(yè)大學(xué)博士研究生吳雙創(chuàng )新運用數學(xué)手段,構建了統計物理學(xué)網(wǎng)絡(luò )模型idopNetworks,利用丘成桐及其合作者發(fā)展出的GLMY同調理論(GLMY homology theory),分析不同疾病的代謝網(wǎng)絡(luò )模型,探究各個(gè)因素及其相互作用對人類(lèi)疾病的影響。該研究成果近日以“復雜疾病的代謝物理學(xué)”(The metabolomic physics of complex diseases)為題發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)上,為解析復雜疾病成因、指導復雜疾病治療及相關(guān)藥物設計提供了嶄新思路。
不同于現有低維度網(wǎng)絡(luò )模型,該團隊構建的統計物理網(wǎng)絡(luò )模型實(shí)現了兩大創(chuàng )新。首先,構建了全面、動(dòng)態(tài)的網(wǎng)絡(luò )模型,將疾病看成一個(gè)由許多因子(如代謝物質(zhì))構成的復雜網(wǎng)絡(luò )系統,通過(guò)引入進(jìn)化博弈論原理,將系統中每一個(gè)因子的作用分解成兩個(gè)組成部分,包括該因子自身的作用,即獨立效應;以及共存因子對它的影響,即依賴(lài)效應;由此,可清晰地反映每個(gè)因子對系統的貢獻。隨后,團隊將前者作為“節點(diǎn)”,后者作為“邊”,構建出一個(gè)全方位、個(gè)性化網(wǎng)絡(luò ),將其稱(chēng)為idopNetworks。其第二個(gè)創(chuàng )新點(diǎn)在于引入代數拓撲中的同調理論分析網(wǎng)絡(luò )。團隊利用丘成桐先生及其合作者最新發(fā)展出的GLMY同調理論,整合入有向圖論(directed graph theory)等數學(xué)理論,分析網(wǎng)絡(luò )中一個(gè)因子向另一因子傳播信號的路線(xiàn)圖,從中發(fā)現系統狀態(tài)變化的拓撲規律,并追蹤網(wǎng)絡(luò )的拓撲結構變化,從而更好地理解疾病發(fā)生發(fā)展的機理。
該項研究以炎性腸疾病為例。炎性腸疾病(inflammatory bowel disease, IBD)是一種特發(fā)性腸道炎癥性疾病,其病因和發(fā)病機制尚未完全明確。利用現有臨床數據,團隊構建出與炎性腸疾病相關(guān)的代謝互作網(wǎng)絡(luò )idopNetworks,獲得了不同代謝物互作關(guān)系這一嶄新研究成果。傳統方法只能識別與炎性腸疾病顯著(zhù)相關(guān)的單個(gè)代謝物,而idopNetworks發(fā)現這些單個(gè)代謝物發(fā)揮的作用并不來(lái)自于其獨立效應,而是源于其他代謝物的調控,即依賴(lài)效應。通過(guò)改變代謝物之間的調控關(guān)系會(huì )導致代謝物自身作用的改變。idopNetworks還揭示了患者從健康狀態(tài)轉向炎性腸疾病,以及從炎性腸疾病轉向健康狀態(tài),代謝物互作關(guān)系的變化。
炎性腸疾病包括潰瘍性結腸炎(UC)和克羅恩病(CD)兩種類(lèi)型,這兩種類(lèi)型是否存在相同的代謝機理,尚未被系統研究過(guò)。團隊利用GLMY同調理論分析UC與CD的idopNetwork,發(fā)現了兩者細微的網(wǎng)絡(luò )拓撲結構差異,且判斷與亞麻酸鹽這一代謝物有關(guān)的網(wǎng)絡(luò )聯(lián)通性是出現差異的重要原因。這顯示了GLMY同調理論在復雜生物系統研究中具有巨大應用潛力。
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